Der kleine Tim ist ein glückliches Kind - bis er eines Tages von einem Baby im Anzug Konkurrenz bekommt. Angeblich ist das Baby sein Bruder. Und dieser Bruder verhält sich wie ein erwachsener "Boss".
Nachdem Boss Baby von der Baby Corp. gefeuert wurde, versucht er, sich in einer Krabbelgruppe im normalen Babyleben zurechtzufinden. Noch schlimmer ist, dass das andere neue Mitglied der Spielgruppe ...
Als die überfüllten Toiletten im örtlichen Museum die Baby-Liebe bedrohen, führt Boss Baby sein neues Außenteam von Krabbelgruppen-Babys auf ihre erste Mission... und dann sogleich auf ihre zweite ...